Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms