Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam3cQ91VU0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam3cQ91VU0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms