Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms