Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms