Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rhbdd2Q8VEK2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rhbdd2Q8VEK2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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