Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk4Q8VEJ3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk4Q8VEJ3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk4Q8VEJ3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk4Q8VEJ3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk4Q8VEJ3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk4Q8VEJ3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk4Q8VEJ3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dkk4Q8VEJ3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dkk4Q8VEJ3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms