Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ccdc71Q8VEG0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc71Q8VEG0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc71Q8VEG0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc71Q8VEG0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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