Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms