Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg8Q8VE18 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Smg8Q8VE18 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Smg8Q8VE18 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smg8Q8VE18 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms