Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms