Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ClmpQ8R373 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms