Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf183Q8QZS5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms