Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw1Q8K4P8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms