Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Defb12Q8K4N3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms