Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trpv3Q8K424 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trpv3Q8K424 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms