Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrrtm1Q8K377 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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