Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rassf9Q8K342 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf9Q8K342 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms