Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms