Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrrdQ8K2M3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms