Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms