Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scara5Q8K299 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms