Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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