Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sde2Q8K1J5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms