Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms