Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps37aQ8CHS8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms