Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc3Q8CHP6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms