Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tshz3Q8CGV9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms