Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms