Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp27Q8CEG8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp27Q8CEG8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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