Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc28bQ8CEG5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc28bQ8CEG5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc28bQ8CEG5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc28bQ8CEG5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc28bQ8CEG5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc28bQ8CEG5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc28bQ8CEG5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc28bQ8CEG5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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