Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx30Q8CE50 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx30Q8CE50 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx30Q8CE50 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx30Q8CE50 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx30Q8CE50 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx30Q8CE50 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx30Q8CE50 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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