Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc9Q8CDN9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms