Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CcinQ8CDE2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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CcinQ8CDE2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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