Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrif1Q8CDD9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms