Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nhlrc3Q8CCH2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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