Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms