Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Aph1bQ8C7N7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Aph1bQ8C7N7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Aph1bQ8C7N7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Aph1bQ8C7N7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aph1bQ8C7N7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Aph1bQ8C7N7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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