Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln3Q8C5U9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ubqln3Q8C5U9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubqln3Q8C5U9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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