Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ccdc113Q8C5T8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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