Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms