Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac7Q8C2B3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms