Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx16Q8C080 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx16Q8C080 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx16Q8C080 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx16Q8C080 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx16Q8C080 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snx16Q8C080 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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