Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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