Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trerf1Q8BXJ2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trerf1Q8BXJ2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trerf1Q8BXJ2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trerf1Q8BXJ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trerf1Q8BXJ2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trerf1Q8BXJ2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms