Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp38Q8BW70 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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