Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx17Q8BVL3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms