Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem260Q8BMD6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms