Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp54Q8BL06 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp54Q8BL06 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms