Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms