Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot10Q8BH15 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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